Eski Windows sistemlerinde (Halen şu an XP de de kullanılabilir )kullanılan FAT dosyalama sistemi Küçük kapasitede olan HDD lerde iyi ve veriye ulaşmada hızlı fakat Bir o kadar da DEFRAG edilmesi gereken bir sistem... Fakat başka dikkat edilmesi gereken nokta HDD nin FAT sistemi güvenlik bakımından oldukça basit sistemdir ...
NTFS (New Technology File System ) Cluster mantığını kullanarak Daha büyük kapasitede HDD lerde hız ve güvenlik bakımından büyük yararları bulunmaktadır ... Ancak Düşük kapasiteli ( 5 ... 10 GB) lik HDD lerde pek farkedilmeyen yani pek fazla performans farkı olmayan bir dosyalama sistemidir.
Güvenlik konusunda Eğer Server sistem kuracaksanız NTFS sistem güvenlik ve çok kullanıcılı bir sistemde büyük bir avantaj sağlamaktadır. Dış sistemlerde port tarayan programcıklar buna örnek olarak R3x i verebilirim NTFS de herhangi bir erişim sağlayamıyor... Artı Cluster Yapısı ile DEFRAG ve diğer dosya sistemi dağınıklığından sizi koruyor...
Server da Active Directory kurmak için zaten NTFS sisteminiz olması gerekiyor...